No sé si tengo una solución, pero lo que sé es que tu descripción del problema es algo confusa (eso pasa cuando le pasa algo a nuestro bebé, verdad?). Veamos:
Sólo tienes conectados estos dos instrumentos via MIDI o hay más ? A veces se crean unos bucles MIDI extraños, y lo que se suele hacer es entrar en el menú «global» de todos los esclavos para configurarlos realmente como esclavos. Es decir, asegúrate que el clock del maestro sea internal y del resto external, que prog change del maestro sea «send» y del resto «receive», igual para control change.
A parte de esto, no conozco muy bien cómo funcionan los secuenciadores de los Korg, pero lo que describes me parece raro ya que es como si el Triton fuera el maestro.
Repito, si tienes más de un instrumento conectados con MIDI, también a veces el orden dentro de la cadena influye.
Bueno, no dudes en volver a contactarme si te he podido ayudar en algo. Suerte.